Apesar de convertidos à Fé, os Targaryen mantinham-se sem prestar contas aos deuses ou aos homens, continuando com sua prática de casamento incestuoso, um pecado abominável para [[Fé dos Sete|Os Sete]]. Quando Aegon I morreu, trinta e sete anos depois da Conquista, e foi sucedido por seu herdeiro nascido de incesto, [[Aenys I Targaryen]], a poderosa e influente milícia conhecida como [[Fé Militante]] se [[Revolta da Fé Militante|revoltou]] contra o Trono de Ferro Targaryen. À época, a [[Mão do Rei|Mão]] de Aenys era [[Maegor I Targaryen|Maegor Targaryen]], seu truculento meio-irmão que acabou herdando o trono após a morte do rei. De forma brutal, Maegor tentou conter a revolta mas não teve êxito. A Fortaleza Vermelha foi construída sob ordens suas durante esse período. O governo de Maegor foi marcado pela tirania e arbitrariedade, que ameaçava a estabilidade em todo o reino. Seu sucessor, [[Jaehaerys I Targaryen|Jaehaerys, o Conciliador]], optou pela diplomacia e negociou com Fé dos Sete, dissolvendo o braço armado da Fé Militante e prometendo-lhes proteção. O governo de Jaehaerys I foi longo e sábio, com a lei e a ordem sendo restauradas. Várias importantes reformas foram impostas ao território, modernizando o reino e trazendo prosperidade.
===A morte dos dragõese guerra civil===
''Veja também: [[Dança dos Dragões]]''