Com o avanço da Guerra, as forças de Tywin tomaram boa parte das terras fluviais e cercaram Correrrio, até enfrentarem sua primeira grande ameaça na Batalha do Ramo Verde. Durante a batalha, Tywin ordenou que o filho Tyrion - que havia conseguido a liberdade através de um julgamento por batalha e descera as montanhas liderando uma tropa de homens dos clãs - organizasse seus homens dos clãs no flanco esquerdo, acreditando que, por serem indisciplinados, quebrariam facilmente, facilitando sua estratégia para derrotar o impetuoso e inexperiente [[Robb Stark]]. No entanto, os homens dos clãs não quebraram, e o comandante dos nortenhos não era Robb, e sim o calculista [[Roose Bolton]]. Os Lannister venceram a batalha, mas isso deu tempo suficiente para que as forças de Robb, que haviam atravessado o Tridente nas Gêmeas, vencessem a tropa de Jaime que cercava Correrrio. Como resultado, Robb capturou Jaime e libertou Correrrio.
Após a morte do Rei Robert, Tywin foi feito novamente Mão do Rei, dessa vez pelo neto, o Rei [[Joffrey Baratheon]]. Depois da batalha, Tywin enviou Tyrion para servir como Mão em sua ausência, dando-lhe a missão de controlar os decretos desmedidos de Joffrey e preparar a cidade contra a ameaça de [[Stannis Baratheon]]. Por sua vez, Tywin se dirigiu para HarrenhallHarrenhal, para dar continuidade à Guerra nas terras fluviais
===''A Fúria dos Reis''===
Tywin se manteve em HarrenhallHarrenhal, ponderando sobre seu próximo passo. No entanto, as forças de Robb partiram para as terras ocidentais, esmagando os restos reagrupados da tropa de Jaime na Batalha de Cruzaboi, chegando a matar Sor [[Stafford Lannister]]. Diante disso, Tywin decidiu marchar em perseguição à Robb, sem saber que o plano do Rei do Norte era exatamente este. Robb pretendia que o Lannister o caçasse pelas terras ocidentais, enquanto ele sangrava suas forças e vivia em suas terras. Tywin foi impedido pela ação temerária de [[Edmure Tully]], que bloqueou sua passagem nas terras fluviais com sua temerária [[Batalha dos Vaus]].
As forças de Tywin estavam sendo flageladas e empurradas para trás, mas o atraso permitiu que batedores chegassem com notícias de Stannis e do perigo que rondava Porto Real. Tywin reagrupou suas forças e iniciou uma marcha forçada para Porto Real, chegando ao fim da Batalha da Água Negra. As forças de Tywin, combinadas às dos Tyrell, atacaram as de Stannis por um dos flancos, esmagando-as. Por sua vez, Tyrion, que muito havia feito pela defesa da cidade, ficou gravemente ferido.
A chegada oportuna de Tywin durante a Batalha da Água Negra permitiu que ele obtivesse quase todo o crédito pela vitória Lannister. Tywin assumiu oficialmente seu cargo de Mão de Joffrey, rebaixando o filho Tyrion para Mestre da Moeda, coisa que o anão viu como um insulto. Ele também arranjou o casamento de Tyrion com [[Sansa Stark]], dizendo-lhe que futuramente ele poderia reclamar [[Winterfell]], negando os direitos do filho caçula sobre Rochedo Casterly. Também fez planos de casar a filha Cersei, oferecendo-a ao herdeiro de [[Jardim de Cima]], [[Willas Tyrell]]. [[Mace Tyrell]] cogitou a hipótese mas, após ser coagido pela mãe, recusou a idéia.
Depois de saber que Robb Stark havia quebrado a promessa aos [[Casa Frey|Frey]] e casado com [[Jeyne Westerling]], e que a [[Casa Westerling]] havia se juntado ao Rei do Norte, Tywin começou a tramar através de cartas com a mãe de Jeyne, [[Sybell Spicer]], com [[Roose Bolton]], que havia mudado de lado após tomar HarrenhallHarrenhal, e com [[Lorde Walder Frey]], que considerava o casamento de Robb um insulto à sua Casa. O [[Casamento Vermelho]] foi fruto direto dessa conspiração, onde Robb Stark foi traído e assassinado, além de ter a maior parte de seu exército liquidado, pondo um fim à Guerra e assegurando a vitória para a Casa Lannister. Sobre isso, Tywin afirmou que:
{{Quote|''...algumas guerras ganham-se com espadas, outras com penas e corvos...''}}