A Rainha Rhaenyra ainda queria Nettles morta, acreditando que a [[Bastardia|bastarda]] era uma traidora. Ela então mandou uma carta para o lorde [[Manfryd Mooton]], comandando que ele matasse a garota. Lorde Mooton se recusou a obedecer, já que Nettles era uma convidada sob seu teto, protegida pela [[Direito de hóspede|lei da hospitalidade]]. Mooton também temia que [[Daemon Targaryen|Daemon]] matassem quem tentasse seguir as ordens de Rhaenyra, já que ele havia se aproximado bastante de Nettles. Lorde Mooton, insistindo que os reis Viserys I e Jaehaerys I jamais dariam ordem tão imoral, decidiu permitir que Nettles fugisse (junto com Daemon), e ergueu a bandeira de Aegon II no terraço de seu castelo.{{Ref|TPATQ}} Pouco depois, Rhaenyra perdeu de vez o marido, quando Daemon morreu na [[Batalha acima do Olho de Deus]].{{ref|fab|A morte dos dragões: Rhaenyra triunfante}}
[[Arquivo:Rhaenyra Targaryen morte.png|thumb|right|300px|Rhaenyra prestes a ser morta por [[SyraxSunfyre]], por [[:Categoria:Imagens por Douglas Wheatley|Douglas Wheatley]], conforme visto em ''[[Fogo & Sangue]]''.]]
O desgoverno de Rhaenyra eventualmente levou a população de Porto Real a [[Revolta de Porto Real (Dança dos Dragões)|se rebelar]]. A revolta tomou conta da capital, com a turba ensandecida ficando mais furiosa especialmente após a notícia da morte de [[Helaena Targaryen]], a mulher de Aegon II, que era amada pelo povo comum. Muitos afirmaram que Helaena foi morta sob as ordens de Rhaenyra. Neste momento, o povo comum da capital começou a odiar profundamente Rhaenyra. As revoltas começaram a se expandir e a rainha acabou perdendo, para fins práticos, o controle da capital. A revolta culminou no [[Assalto ao Fosso dos Dragões]], quando o povo invadiu o local onde os Targaryen mantinham seus dragões, matando cinco dos animais. O último filho vivo de Rhaenyra do seu primeiro casamento, [[Joffrey Velaryon]], morreu durante a revolta na capital.{{Ref|FAB|A morte dos dragões: Rhaenyra destituída}} Os outros dois filhos tinham morrido antes: [[Lucerys Velaryon|Lucerys]] assassinado na [[Baía dos Naufrágios]] (em {{data|129}}) e [[Jacaerys Velaryon|Jacaerys]] na [[Batalha da Goela]] (em {{data|130}}).{{Ref|FAB|A morte dos dragões: O dragão vermelho e o dourado}}