Antes de nascer, a sua irmã mais velha, a Princesa [[Daenerys Targaryen (filha de Jaehaerys I)|Daenerys]] pediu para sua mãe lhe dar uma irmãzinha. Príncipe Aemon nasceu em {{Data|55}} em [[Pedra do Dragão]] e não só a Rainha e o Rei comemoraram seu nascimento, mas todo o povo de [[Porto Real]], quando estes voltaram para sua cidade. A partir de seu nascimento, o Rei [[Jaehaerys I Targaryen]] passou a referir-se a ele como seu herdeiro, o que causou atrito com a Rainha [[Alysanne Targaryen]], que achava que a Princesa [[Daenerys Targaryen (filha de Jaehaerys I)|Daenerys]] deveria ser a herdeira. Como forma de acordo entre os dois, Rei [[Jaehaerys I Targaryen|Jaehaerys]] decidiu casá-los para que ambos governassem juntos, mas a Rainha não ficou completamente satisfeita com a decisão.{{ref|fab|O Longo Reindo Jaehaerys e Alysanne | Política, Progênie e Provação}}
Em {{Data|68}}, o Rei [[Jaehaerys I Targaryen|Jaehaerys]] e a Rainha [[Alysanne Targaryen|Alysanne]] anunciaram publicamente que Príncipe Aemon e a Senhorita [[Jocelyn Baratheon|Jocelyn]] iriam se casar, contrariando o senso comum de casar o herdeiro do Trono de Ferro com sua irmã, a Princesa [[Alyssa Targaryen]], que mais tarde se casou com o Príncipe [[Baelon Targaryen (Filho de Jaehaerys I)|Baelon]]. O referido casamento aconteceu em {{Data|70}} e foi um evento esplêndido e memorável.{{ref|fab|O Longo Reindo Jaehaerys e Alysanne | Política, Progênie e Provação}}
Em {{data|72}}, foi realizado um torneio em [[Valdocaso]] para comemorar o casamento do jovem Lorde Darklyn com a filha do lorde [[Theomore Manderly]]. Durante o torneio, Príncipe Aemon Targaryen foi o campeão do corpo-a-corpo ao derrotar o Príncipe [[Baelon Targaryen (Filho de Jaehaerys I)|Baelon]] (após este se render). Ainda no mesmo torneio, Príncipe Aemon, com 17 anos, foi nomeado cavaleiro após se sair bem nas justas. Logo após isso, Príncipe Aemon tomou o dragão [[Caraxes]] como sua montaria. Príncipe [[Baelon Targaryen (Filho de Jaehaerys I)|Baelon]] não podia ficara ficar para trás de seu rival, então um ano depois ele conquistou seu título de cavaleiro e tomou [[Vhagar]] como sua montaria pessoal.{{ref|fab|O Longo Reindo Jaehaerys e Alysanne | Política, Progênie e Provação}}
No sétimo dia da sétima lua de {{Data|74}}, Príncipe Aemon e a Senhora [[Jocelyn Baratheon|Jocelyn]] tiveram sua primeira (e única) prole: a Princesa [[Rhaenys Targaryen (A Rainha Que Nunca Foi)|Rhaenys Targaryen]], a primeira neta do Rei [[Jaehaerys I Targaryen|Jaehaerys]] e a Rainha [[Alysanne Targaryen|Alysanne]].{{ref|fab|O Longo Reindo Jaehaerys e Alysanne | Política, Progênie e Provação}}
Em {{Data|81}}, com 26 anos, Príncipe Aemon era tão competente e bem visto na corte que o Rei Rei [[Jaehaerys I Targaryen|Jaehaerys]] o incluiu no [[Pequeno Conselho]] como [[Mestre das Leis]], função que ele executou com muita competência.{{ref|fab|O Longo Reindo Jaehaerys e Alysanne | Política, Progênie e Provação}}
Em {{Data|83}} a [[Quarta Guerra Dornesa]] começou quando o Príncipe de [[Dorne]], [[Morion Martell]] resolveu atacar [[Westeros]], mas o Rei [[Jaehaerys I Targaryen]] tinha espiões em [[Dorne]] e antes mesmo de eles desembarcarem no [[Cabo da Fúria]], o Rei [[Jaehaerys I Targaryen]], com [[Vermithor]], o Príncipe Aemon, com [[Caraxes]] e o Príncipe [[Baelon Targaryen (Filho de Jaehaerys I)|Baelon]], com [[Vhagar]], desceram das nuvens e [[Quarta Guerra Dornesa|acabaram com a invasão ]] antes mesmo dela começar, matando vários [[Dorne]]ses.{{ref|fab|Jaehaerys e Alysanne|Triunfos e Tragédias}}
Em {{Data|88}} o Rei [[Jaehaerys I Targaryen]] partiu para uma turnê pelas [[Terras Ocidentais]] após uma briga com a Rainha [[Alysanne Targaryen]] e tanto Príncipe Aegon como Príncipe [[Baelon Targaryen (Filho de Jaehaerys I)|Baelon]] o acompanharem em algumas dessas viagens.{{ref|fab|O Longo Reindo Jaehaerys e Alysanne | Política, Progênie e Provação}}