A primeira vez que Aerys finalmente deixou a [[Fortaleza Vermelha]] novamente seria para participar do [[Torneio em Harrenhal]] em {{data|281}}. Ele fez isso apenas por insistência de Varys, que alegou que o Príncipe Rhaegar planejava usar o [[Torneios em Westeros|torneio]] como um pretexto para recrutar senhores com a intenção de tomar o trono de seu pai.{{ref|aDwD|67}} Um [[cavaleiro misterioso]], o [[Cavaleiro da Árvore que Ri]], competiu no torneio. Com a certeza de que o cavaleiro tinha escondido sua identidade porque ele era um inimigo da coroa, Aerys ordenou Rhaegar que descobrisse sua identidade, mas nenhuma evidência foi encontrada. Rhaegar passou a ganhar o torneio e chocou todos os presentes pela coroação [[Lyanna Stark]] como a [[Rainha do Amor e da Beleza]], ao invés de Princesa Elia.
Algum tempo depois, o príncipe Rhaegar desapareceu com Lyanna, aparentemente tendo a raptado. Seu irmão mais velho, [[Brandon Stark|Brando]] montou até Porto Real com vários amigos, todos os filhos de proeminentes Senhores do [[O Norte|senhores do norte]]. Chegando da Fortaleza Vermelha, Brandon rugiu para Rhaegar para "vir e morrer." Como se viu, Rhaegar não estava presente - mas Aerys estava. O rei tinha Brandon e seus companheiros presos sob a acusação de conspirar contra a vida do príncipe herdeiro, exigindo que seus pais se apresentassem no tribunal para responder por crimes de seus filhos. Quando o fizeram, Aerys tinha todos eles executados sem julgamento. Lorde [[Rickard Stark]] foi queimado vivo por fogo vivo enquanto Brandon observava, amarrado em um instrumento de tortura que o levou a estrangular a si mesmo em sua luta para salvar seu pai. Sua paranóia ainda insatisfeita, o rei ordenou que Lorde Jon Arryn a enviasse-lhe as cabeças de seus dois protegidos, [[Eddard Stark]] e o noivo Lyanna, [[Robert Baratheon]], tanto de quem ele acredita ser culpado de participar da "conspiração" por conta de seus laços com a família Stark.. Arryn se recusou, e os atos brutais do rei provocou uma cadeia de eventos que se tornaria conhecido como a Guerra do Usurpador para os lealistas Targaryen e Rebelião de Robert para aqueles que lutaram ao lado dos rebeldes. Todas as [[Casa Arryn]], [[Casa Stark]], [[Casa Baratheon]] e a [[Casa Tully]] se rebelaram contra o Trono de Ferro, unindo atrás da pretensão de Robert Baratheon, que era descendente de sangue real através de sua avó [[Rhaelle Targaryen]], tia do rei.
A Mão de Aerys no início da rebelião ainda era Owen Merryweather, mas ele foi rapidamente substituído por seu fracasso em agir para conter a agitação em seus estágios iniciais. Logo depois, Aeryes virou-se para Lorde [[Jon Connington]], um amigo próximo de Rhaegar, mas ele perdeu para as forças rebeldes no [[Septo de Pedra]] na [[Batalha dos Sinos]] e foi substituído pelo Lorde [[Qarlton Chelsted]]. Por este ponto o rei estava ficando com medo de uma vitória rebelde, e traçou um [[Plano do Fogovivo|plano]] para ganhar uma vingança final contra seus inimigos no caso em que eles tomassem a capital. Ele ordenou que os piromantes criassem uma reserva maciça de fogo e botar em torno de Porto Real, conspirando para queimar toda a cidade e matar todos metade do seu milhão de habitantes, em vez de permitir que Robert de tê-la intacta. Ao descobrir a trama, Lorde Chelsted confrontou Aerys e, quando percebeu que o rei não poderia ser dissuadido, renunciou a sua posição em desgosto, atirando sua corrente no pé do rei. Aerys o queimou vivo. A [[Guilda dos Alquimistas]] tinham benefícios reais desde o Desafio de Valdocaso devido à obsessão do rei com fogo, e Aerys nomeou o chefe da aliança, [[Rossart]], sua mão final.
Após a [[Batalha do Tridente]], onde o príncipe [[Rhaegar Targaryen|Rhaegar]] foi morto e o exército real derrotado, uma vitória rebelde era quase certa. Aerys enviou a rainha Rhaella (então recém-grávida de princesa Daenerys) e Príncipe Viserys até [[Pedra do Dragão]] para escapar do [[Saque de Porto Real]] que estava por vir. No entanto, ele manteve a princesa Elia e suas jovens crianças, [[Rhaenys Targaryen|Rhaenys]] e [[Aegon Targaryen|Aegon]] com ele no Fortaleza Vermelha, acreditando que eles eram necessários como reféns para garantir a fidelidade da [[Casa Martell]] e de [[Dorne]]. Esta decisão acabaria por levar à sua morte brutal nas mãos de Sor [[Amory Lorch]] e Sor [[Gregor Clegane]]