No começo da guerra, o príncipe Aemond matou o príncipe [[Lucerys Velaryon]], filho de Rhaenyra, sobre [[Ponta Tempestade]]. O lorde [[Borros Baratheon]], Senhor das [[Terras da Tempestade]], declarou apoio a Aegon II. Quando Aemond retornou, um exultante Aegon deu boas vindas a ele com um banquete, embora a rainha-viúva Alicent e seu pai, Sor [[Otto Hightower]], o [[Mão do Rei]], estavam preocupados com a repercussão da morte do príncipe. E a vingança não tardou, com o Príncipe Daemon mandando dois assassinos, [[Sangue]] e [[Queijo]], para matar o pequeno [[Jaehaerys Targaryen (filho de Aegon II)|Jaehaerys]], na Fortaleza Vermelha. A irmã-esposa de Aegon, a rainha [[Helaena Targaryen]], ficou chocada e entrou numa espiral de depressão e tristeza, com a perda do filho mais velho.{{Ref|TWOIAF|19}} Enquanto Sangue foi capturado e torturado até a morte, Queijo nunca foi encontrado. Tomado pela fúria, Aegon ordenou que todos os caçadores de ratos na cidade fossem enforcados (essa era a profissão de Queijo). Aegon e sua esposa passaram a dormir em cômodos diferentes pelo resto das vidas, com o rei se afogando em bebida.{{Ref|FAB|A morte dos dragões: Um filho por um filho}}
[[Arquivo:Sunfyre is injured.jpg|thumb|300px350px|esquerda|Aegon II e [[Sunfyre]] sendo feridos na [[Batalha de Pouso de Gralhas]], desenhado por [[:Categoria:Imagens por Jordi Gonzalez Escamilla|Jordi Gonzales Escamilla]].]]
A guerra começou mal para os Verdes, sofrendo uma série de derrotas nas [[Terras Fluviais]]. Sor Otto tentou angariar aliados, mandando cartas e contratando mercenparios. Aegon, contudo, acreditava que o avô era lento demais e via a cautela dele como covardia. Para piorar, as Casas [[Casa Velaryon|Velaryon]], [[Casa Stark|Stark]], [[Casa Arryn|Arryn]] e a maioria dos [[Terras Fluviais|Senhores dos Rios]] declararam apoio a Rhaenyra, complicando ainda mais a situação. Aegon começou a afogar seus medos em vinho forte. Com [[Corlys Velaryon]], [[Senhor das Marés]], iniciou um bloqueio naval contra Porto Real, fechando a [[Baía da Água Negra]], Sor Otto entrou em contato com a [[Triarquia]] e [[Dalton Greyjoy]], [[Senhor das Ilhas de Ferro]], por ajuda. Com o seu avô hesitante, Aegon tirou a posição de Otto de Mão do Rei e a deu para Sor Criston Cole. A nova Mão optou por exercer a [[Justiça do Rei]] sobre aqueles aprisionados na capital acusados de simpatia por Rhaenyra. Aqueles que se recusaram a trocar de leadade e apoiar Aegon foram executados. O rei queria atacar Pedra do Dragão, mas como não tinha uma marinha nem de perto tão expressiva como a dos Velaryons, acabou sendo persuadido a desistir.{{Ref|FAB|A morte dos dragões: O dragão vermelho e o dourado}}