===Reinado de Maegor===
Jaehaerys estava na [[Pedra do Dragão]] para a cremação de seu pai. Em poucas horas, a rainha viúva Alyssa fugiu para [[Derivamarca]], residência de do [[Aethan Velaryon | do pai dela]], com Jaehaerys e Alysanne.{{Ref|TSOTD}}{{Ref|FAB|Os filhos do dragão}} Enquanto isso, a rainha viúva [[Visenya Targaryen]] voou para [[Pentos]] para resgatar seu filho [[Maegor I Targaryen | Maegor]] de seu exílio. Uma vez de volta a Pedra do Dragão, Maegor reivindicou o [[Trono de Ferro]] para si, ignorando a reivindicação do irmão mais velho de Jaehaerys, Aegon.{{Ref|TSOTD}}{{Ref|FAB|Os filhos do dragão}}
Mais tarde naquele ano, após uma visita de Visenya e [[Vhagar]], Alyssa trouxe Jaehaerys, sua irmã Alysanne e seu irmão [[Viserys Targaryen (filho de Aenys I) | Viserys]] para [[Porto Real]], onde eles testemunharam o casamento do rei Maegor com [[Tyanna da Torre]]. Em {{Data|44}}, Jaehaerys, Alysanne e sua mãe residiam em Pedra do Dragão como reféns da rainha viúva Visenya. No caos que seguiu após a morte de causas naturais de Visenya naquele ano, Jaehaerys, sua irmã Alysanne e sua mãe Alyssa fugiram da ilha. Em retaliação, o Rei Maegor fez com que o irmão de Jaehaerys, Viserys, que residia em Porto Real, fosse torturado até a morte. Como o irmão mais velho de Jaehaerys, [[Aegon Targaryen (filho de Jaehaerys I) | Aegon]], foi morto por Maegor na [[Batalha sob o Olho de Deus | batalha]] no ano anterior, Jaehaerys se tornou o filho vivo mais velho do falecido Rei Aenys I.{{Ref|TWOIAF|16}}{{Ref|TSOTD}}{{Ref|FAB|Os filhos do dragão}}