[[File:Marc Simonetti Tournament.jpg|Um grande torneio realizado em [[Porto Real]] em {{Data|98}} para celebrar o quinquagésimo ano de Jaehaerys do [[Trono de Ferro]]. Arte por [[:Categoria:Imagens por Marc Simonetti|Marc Simonetti]] ©.|thumb|350px|right]]
Em {{Data|84}}, Jaehaerys descobriu que sua filha [[Saera Targaryen | Saera]] havia dormido com três jovens cavaleiros. Ele a confrontou e a confinou em seus aposentos depois que ela sugeriu que poderia se casar com os três, comparando-se ao Rei [[Maegor I Targaryen | Maegor, o Cruel]] e suas muitas esposas. Furioso e envergonhado, Jaehaerys afirmou mais de uma vez que Saera não era mais sua filha. Alysanne tentou fazer o rei mudar de ideia, mas depois que Saera tentou entrar no [[Fosso dos Dragões]] para roubar um [[dragão]], Jaehaerys a confinou em uma cela da torre, lidou com os três cavaleiros em questão, matando pessoalmente um (Sor [[Braxton Beesbury]]) em um [[julgamento por combate]] que o cavaleiro exigiu. Como punição para Saera, ela foi enviada para [[Vilavelha]] para servir à [[Fé dos Sete]] como uma noviça por um tempo, onde sua irmã mais velha [[Maegelle Targaryen | Maegelle]] poderia cuidar dela. Em {{Data|85}}, no entanto, Saera escapou para [[Lys]] onde se tornou uma [[prostituta]] em um [[Jardins dos prazeres|jardim de prazer]]. Quando Alysanne proclamou que os lysenos haviam transformado sua filha em uma prostituta, Jaehaerys respondeu: "''Ela sempre foi''". No entanto, aqueles mais próximos de Jaehaerys afirmam que ele nunca foi o mesmo depois que Saera o desonrou e o abandonou, embora ele sempre recusasse Alysanne a trazer Saera para casa, uma discussão que levou à [[Primeira Discórdia]] em {{Data|87}}{{Ref|FAB|O longo reinado Jaehaerys e Alysanne: Política, progênie e provação}} Sua divisão duraria dois anos, durante os quais Jaehaerys estava principalmente em um progresso real. Ele visitou [[Rochedo Casterly]] e os assentos dos grandes senhores das [[terras ocidentais]], até parando em [[Ilha de Bela]]. Ele inspecionou as obras rodoviárias e fez paradas não planejadas em cidades e castelos menores. Ao todo, o rei ficou longe da [[Fortaleza Vermelha]] por muito mais tempo do que originalmente pretendido, e nem Aemon nem Baelon, que se juntaram a ele em algumas dessas visitas, conseguiram convencê-lo a voltar para casa. Depois das terras do oeste, Jaehaerys viajou para a [[Campina]], começando um segundo progresso antes que o primeiro terminasse. Suas visitas incluíram [[Paço de Codorniz]], [[Carvalho Velho]], [[Jardim de Cima]] e [[Campoverde]]. Ele terminou sua jornada em [[Vilavelha]], onde Maegelle o convenceu a se reunir com Alysanne.{{Ref|FAB|O longo reinado Jaehaerys e Alysanne: Política, progênie e provação}}
Em {{Data|92}}, após a morte do Príncipe Aemon em [[Tarth]], Jaehaerys nomeou o irmão de Aemon, Baelon, como o novo [[Príncipe de Pedra do Dragão]] e herdeiro do trono, passando a única filha de Aemon, a Princesa Rhaenys, bem como seus filhos por nascer. Embora Baelon fosse muito amado, alguns não aprovavam. O mais proeminente deles era a Rainha Alysanne, que ficou furiosa porque Rhaenys estava sendo preterida por causa de seu sexo apenas. Assim começou a [[Segunda Discórdia]] entre Jaehaerys e sua irmã-esposa. Alysanne mais uma vez partiu para Pedra do Dragão, dizendo a Jaehaerys que se ele sentisse que uma mulher era menos útil do que um homem, ele não precisaria mais dela. Eles foram reconciliados novamente em {{Data|94}}, mais uma vez por sua filha Maegelle.{{Ref|TWOIAF|17}}{{Ref|FAB|Herdeiros do dragão: Uma questão de sucessão}}